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相似基因

相似基因

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【问题描述】

  大家都知道,基因可以看作一个碱基对序列。它包含了 4 种核苷酸,简记作A,C,G,T。生物学家正致力于寻找人类基因的功能,以利用于诊断疾病和发明药物。在一个人类基因工作组的任务中,生物学家研究的是:两个基因的相似程度。因为这个研究对疾病的治疗有着非同寻常的作用。两个基因的相似度的计算方法如下:
  对于两个已知基因,例如AGTGATG和GTTAG,将它们的碱基互相对应。当然,中间可以加入一些空碱基-,例如:
      说明 
  这样,两个基因之间的相似度就可以用碱基之间相似度的总和来描述,碱基之间的相似度如下表所示:
      说明   
  那么相似度就是:(-3)+5+5+(-2)+(-3)+5+(-3)+5=9。
  因为两个基因的对应方法不唯一,例如又有:
      说明 
  相似度为:(-3)+5+5+(-2)+5+(-1)+5=14。

  规定两个基因的相似度为所有对应方法中,相似度最大的那个。

【输入格式】

  共两行。每行首先是一个整数,表示基因的长度;隔一个空格后是一个基因序列,序列中只含A,C,G,T四个字母。1<=序列的长度<=100。

【输出格式】

  仅一行,即输入基因的相似度。

【输入输出样例1】

 Input

7 AGTGATG
5 GTTAG

 Output

14

【数据限制】

  1<=序列的长度<=100。

【来源】

  Mr.he

信息

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4
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动态规划 | LCS 点击显示
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(无)
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